Как быть с антибиотиком?

Здравствуйте! Дочка (1 год) заболела, началось все с повышения температуры. Держалась она 3 дня довольно высокой, жаропонижающие практически не помогали. Врач смотрел - красное горло. Кашля и насморка не было. Начали пить амоксиклав ( всего пропили его 3 дня), после первого же применения стало лучше, температура снизилась на несколько часов, а следующие 2 дня опять держалась на высоких цифрах. Нас положили в стационар. Там начали колоть цефтриаксон 2 р/день ( 2 дня), после первого же укола Т снизилась и не поднималась, но начался понос несмотря на принимаемый лактобактерин, стул стал зеленый. У меня вопрос: можно ли завершить лечение цефтриаксоном , с учетом того, что до этого дочка 3 дня принимала амоксиклав? (Со стационара мы ушли, т.к. боюсь диареи, со старшей дочкой был очень негативный опыт применения цефтриаксона). Не появится ли резистентность микробов к нему в таком случае?